R/preprocessing_filtering_reduction.R
preprocess_feature_size_only.RdPreprocess scExp - size only
preprocess_feature_size_only(scExp)
| scExp | A SingleCellExperiment Object |
|---|
A SingleCellExperiment object.
#>#> 6 x 300 sparse Matrix of class "dgCMatrix"#>#> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . . 3.885670e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . . 1.942836e-07 1.942836e-07 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 . . . . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . . . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . 5.828506e-07 . #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . . . . #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 . 5.828507e-06 6.372501e-05 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . 5.439939e-05 . . #> chr1_15441351_20588466 . . 1.651410e-05 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . 7.149633e-05 . . #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 3.885671e-07 3.885671e-07 4.721090e-05 #> #> chr1_1_5147117 . 1.942835e-07 . 3.885670e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . . . . 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . . 3.885671e-07 . #> chr1_20588467_25735583 . . . . . #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-07 . . 2.389688e-05 3.885671e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 6.450213e-05 7.654771e-05 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . . 5.673080e-05 #> chr1_10294234_15441350 5.828506e-07 . . 7.751912e-05 #> chr1_15441351_20588466 . 3.885671e-07 . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . . 5.828506e-07 #> chr1_25735584_30882699 5.595366e-05 . . 3.885671e-07 #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 5.828507e-07 3.885671e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . 2.175975e-05 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 . 1.942835e-07 . 5.789649e-05 #> chr1_5147118_10294233 . . . . #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 . 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 8.023911e-05 1.942836e-07 . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 1.942835e-07 . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 1.942836e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 . . 1.942835e-07 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 3.730244e-05 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . 1.942835e-07 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . . . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . 8.140481e-05 . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . 3.905099e-05 1.476555e-05 #> chr1_25735584_30882699 2.409116e-05 . . . #> #> chr1_1_5147117 . . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 3.807957e-05 . . 5.012515e-05 #> chr1_15441351_20588466 3.885671e-07 1.942836e-07 . 8.490191e-05 #> chr1_20588467_25735583 . . . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . 2.214832e-05 . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . 4.507379e-05 #> chr1_10294234_15441350 3.885670e-07 3.885670e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 . 1.087988e-05 . 3.846814e-05 #> chr1_20588467_25735583 . 1.942835e-07 3.885670e-07 . #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 . 1.942835e-07 . . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 . . 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 1.942836e-07 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 1.126844e-05 1.942835e-07 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . . . 5.265084e-05 #> #> chr1_1_5147117 . . 3.885670e-07 2.622827e-05 #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 1.942836e-07 5.828507e-07 . #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 5.828506e-07 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 5.362225e-05 1.942835e-07 . . #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . . . . #> chr1_10294234_15441350 1.806837e-05 . . . #> chr1_15441351_20588466 . . . . #> chr1_20588467_25735583 . 3.730244e-05 1.942835e-07 2.156547e-05 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 6.838780e-05 3.885670e-07 5.828506e-07 . . . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 1.942836e-07 . . 7.518774e-05 . #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . . . . #> chr1_15441351_20588466 2.545115e-05 1.942836e-07 1.942836e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 . 4.857088e-05 . . 9.519892e-06 . #> chr1_25735584_30882699 5.828507e-07 . 1.942836e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 1.222043e-04 . . . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 . 3.361106e-05 #> chr1_10294234_15441350 . 6.897065e-05 3.885670e-07 . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 . . 2.331402e-06 3.943955e-05 #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 3.885671e-07 #> #> chr1_1_5147117 . . . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 4.604519e-05 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 5.828506e-07 3.885670e-07 . 3.885670e-07 #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 2.331402e-05 1.942835e-07 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . . 5.323369e-05 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 . . . 1.670839e-05 #> #> chr1_1_5147117 . . . 3.438818e-05 #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 1.942836e-07 1.942836e-07 6.333644e-05 #> chr1_10294234_15441350 . 1.903978e-05 . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . 3.885671e-07 6.897066e-05 #> chr1_20588467_25735583 . 1.942835e-07 . . #> chr1_25735584_30882699 . . . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 3.885670e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 3.555389e-05 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . 3.885671e-07 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . . . #> chr1_25735584_30882699 4.293667e-05 1.942836e-07 4.623949e-05 2.758826e-05 #> #> chr1_1_5147117 3.885670e-07 . 8.198764e-05 . #> chr1_5147118_10294233 3.108537e-05 3.885671e-07 4.837661e-05 . #> chr1_10294234_15441350 . . 6.722210e-05 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 . . 5.265083e-05 5.925647e-05 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . . 1.107416e-05 #> #> chr1_1_5147117 2.719969e-05 1.942835e-07 . . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . 1.107416e-05 . #> chr1_15441351_20588466 . 3.885671e-07 . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 . 3.885670e-07 . . #> chr1_25735584_30882699 3.147394e-05 . 3.885671e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . 2.506257e-05 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 1.942836e-07 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 3.885670e-07 6.644496e-05 6.799923e-05 . #> chr1_15441351_20588466 . . . . #> chr1_20588467_25735583 1.165701e-06 . 3.885670e-07 1.165701e-06 #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 5.828507e-07 #> #> chr1_1_5147117 5.828506e-07 . . . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . 3.885671e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . . . 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 3.885671e-07 . . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 2.428544e-05 . 3.885671e-07 #> #> chr1_1_5147117 . . . . . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 . . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . 3.244535e-05 . . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 . 3.322248e-05 1.942835e-07 . . #> chr1_25735584_30882699 . . . . . #> #> chr1_1_5147117 . 2.700541e-05 . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . 4.13824e-05 . #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 1.942835e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 . 1.554268e-05 . . #> chr1_20588467_25735583 . 5.206798e-05 . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . . . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 1.651410e-05 3.963385e-05 4.177096e-05 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 3.594245e-05 3.769100e-05 . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . 3.885671e-07 . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . 3.574817e-05 #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 9.714178e-07 . . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . 1.165701e-06 2.991966e-05 . #> chr1_15441351_20588466 3.555389e-05 3.885671e-07 . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 8.159908e-06 . 3.244535e-05 3.885670e-07 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 3.885671e-07 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 2.078834e-05 7.285632e-05 1.942835e-07 1.515411e-05 #> chr1_15441351_20588466 . . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 2.117690e-05 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . . . . #> #> chr1_1_5147117 3.846814e-05 . . . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 1.942836e-07 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . . . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . . . #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . 5.828506e-07 3.885670e-07 3.885670e-07 #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 2.564542e-05 3.885670e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 2.175975e-05 . . #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . 1.379413e-05 . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 5.828507e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 . . 1.942835e-07 3.88567e-07 #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-05 . . . #> #> chr1_1_5147117 . . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . 7.771342e-07 3.885671e-07 6.119932e-05 #> chr1_10294234_15441350 . 3.477675e-05 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 1.942836e-07 2.409116e-05 #> chr1_20588467_25735583 2.11769e-05 . . . #> chr1_25735584_30882699 . . . . #> #> chr1_1_5147117 . . 3.885670e-07 . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 2.156547e-05 . . . #> chr1_15441351_20588466 . . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . 1.942835e-07 7.771341e-07 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 3.885671e-07 3.399962e-05 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . . . #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 3.885671e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . . 1.379413e-05 . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 1.223986e-05 . #> chr1_20588467_25735583 . . 3.943955e-05 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 4.993087e-05 3.885671e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 . 2.039977e-05 1.942835e-07 5.828506e-07 #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 3.885670e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 8.742760e-06 . 5.847935e-05 . #> chr1_20588467_25735583 . . 1.942835e-07 6.586211e-05 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 . . 1.476555e-05 . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . . #> chr1_10294234_15441350 . . 3.885670e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . 1.359985e-06 3.885671e-07 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . 1.942835e-07 . . #> chr1_25735584_30882699 5.537081e-05 . . 3.885671e-07 #> #> chr1_1_5147117 3.885670e-07 5.828506e-07 . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 3.885670e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 . . . . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 3.885670e-07 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . 2.137119e-05 3.885671e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . . 5.828506e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 . . 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . 2.758826e-05 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 3.885671e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 . . . . #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 3.594246e-05 . . . #> chr1_10294234_15441350 2.603399e-05 1.942835e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 1.942835e-07 . 3.885670e-07 1.146273e-05 #> chr1_5147118_10294233 . 1.301700e-05 . . . #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . 1.942835e-07 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 6.022790e-06 . . 1.942836e-07 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 . 1.942835e-07 . 1.942835e-07 5.070800e-05 #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . 1.942836e-07 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . 3.885671e-07 . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . . 3.885670e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 4.274238e-06 #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . 3.108537e-05 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 2.758826e-05 . . 6.217073e-06 #> chr1_15441351_20588466 3.807958e-05 . . 5.051372e-05 #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . 3.885671e-07 2.661685e-05 . #> #> chr1_1_5147117 . 3.885670e-07 . . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . . #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 3.885670e-07 5.828506e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . . . #> chr1_20588467_25735583 3.341677e-05 . 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . 2.195404e-05 . . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 3.885671e-07 3.885671e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 . . . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 3.885670e-05 . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . 4.507379e-05 . . . #> chr1_10294234_15441350 . . 3.885670e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 . 3.885671e-07 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 . 5.828506e-07 . . . #> chr1_25735584_30882699 5.828507e-07 . . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . 6.022789e-06 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . 3.982813e-05 4.274238e-06 #> chr1_10294234_15441350 . 3.885670e-07 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 1.359985e-06 . . . #> chr1_20588467_25735583 . . 3.885670e-07 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 8.257050e-05 . 2.350831e-05 . #> chr1_5147118_10294233 . . 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . . . . #> chr1_20588467_25735583 . 1.942835e-07 . 2.622827e-05 #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-07 3.885671e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 . . . #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 . . 4.429664e-05 1.107416e-05 #> chr1_25735584_30882699 . 6.081075e-05 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . 1.165701e-06 7.771341e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 . 3.885670e-07 #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 1.942836e-07 1.942836e-07 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 . . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 . . 4.740518e-05 . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . 3.885671e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . . . 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 3.885671e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 . . . 5.362225e-05 #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 1.942836e-07 3.127965e-05 #> #> chr1_1_5147117 3.885670e-07 . 1.942835e-07 1.670838e-05 #> chr1_5147118_10294233 3.419391e-05 . . 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 2.428544e-05 . . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 1.398841e-05 5.828506e-07 . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 1.942836e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 . . . . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . 1.942836e-07 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 3.885670e-07 . . 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . . . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . 5.265083e-05 5.828506e-07 4.682233e-05 #> chr1_25735584_30882699 . . . . . #> #> chr1_1_5147117 . 1.942835e-07 3.885670e-07 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 2.447973e-05 . 1.942836e-07 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 . 1.243415e-05 #> chr1_20588467_25735583 3.166821e-05 . 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 2.953110e-05 1.942836e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 . . . 1.146273e-05 #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . . . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 1.942835e-07 . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . . 4.954230e-05 #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 . . 1.942835e-07 1.981692e-05 #> chr1_15441351_20588466 4.390808e-05 . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . 1.107416e-05 . #> chr1_5147118_10294233 . 1.942836e-07 . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . . 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 3.885671e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 . . 1.359985e-06 #> chr1_25735584_30882699 . 3.885671e-07 1.942836e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . . 5.828506e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 1.126844e-05 1.942835e-07 1.942835e-07 6.391928e-05 #> chr1_15441351_20588466 3.885671e-07 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 . . 3.885670e-07 3.885670e-07 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . 2.059406e-05 9.714178e-07 #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 3.885670e-07 . . #> chr1_5147118_10294233 . . . . #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . . #> chr1_15441351_20588466 . 3.885671e-07 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 . 3.885670e-07 . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 . 3.885671e-07 . . #> chr1_10294234_15441350 . . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 . . 1.942836e-07 . #> chr1_20588467_25735583 4.390808e-05 . . . #> chr1_25735584_30882699 5.556510e-05 1.942836e-07 1.942836e-07 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 2.350831e-05 . . #> chr1_5147118_10294233 . . . . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 3.555389e-05 . . #> chr1_20588467_25735583 7.771341e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 1.942836e-07 7.849056e-05 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 3.730244e-05 . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 . . 1.942836e-07 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 1.554268e-05 . 5.439940e-05 . #> chr1_20588467_25735583 1.165701e-06 . 5.828506e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 4.585091e-05 . 2.914253e-06 3.885670e-07 #> chr1_5147118_10294233 5.828507e-07 3.885671e-07 . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 1.942835e-07 . . . #> chr1_15441351_20588466 . 1.029703e-05 . 3.885671e-07 #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 . 1.942835e-07 3.885670e-07 #> chr1_25735584_30882699 . 1.942836e-07 . . #> #> chr1_1_5147117 3.885670e-07 3.88567e-07 . . #> chr1_5147118_10294233 5.828507e-07 . 7.771342e-07 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 6.294786e-05 3.88567e-07 . . #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 . . 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 3.885671e-07 . 3.885671e-07 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 5.245655e-05 . 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . . . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . 1.087988e-04 . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 . 3.885670e-07 . . #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . 3.885671e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 4.351952e-05 3.555389e-05 . #> chr1_10294234_15441350 . . 3.885670e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . . 3.885671e-07 . #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 3.885670e-07 . 3.885670e-07 #> chr1_25735584_30882699 . 5.828507e-07 . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 5.828506e-07 1.942835e-07 1.942835e-07 #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 1.942836e-07 1.942836e-07 . #> chr1_10294234_15441350 . 2.506257e-05 . . #> chr1_15441351_20588466 . 1.942836e-07 . . #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 . . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 1.942836e-07 . . . #> #> chr1_1_5147117 . . . . #> chr1_5147118_10294233 . . . 9.714178e-06 #> chr1_10294234_15441350 5.828506e-07 4.798803e-05 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 . 3.885671e-07 1.942836e-07 2.370259e-05 #> chr1_20588467_25735583 . 8.373620e-05 1.942835e-07 2.953109e-05 #> chr1_25735584_30882699 . . . 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . . . . #> chr1_5147118_10294233 . . . . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 5.828506e-07 . . 1.942835e-07 . #> chr1_15441351_20588466 4.526807e-05 . . . . #> chr1_20588467_25735583 . . 1.243415e-05 5.828506e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . . . . 3.885671e-07 #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 4.313094e-05 3.924527e-05 3.885670e-07 #> chr1_5147118_10294233 . 6.022790e-06 . 1.942836e-07 #> chr1_10294234_15441350 . . . 3.574817e-05 #> chr1_15441351_20588466 . . . . #> chr1_20588467_25735583 3.885670e-07 . . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . . 5.828507e-07 . #> #> chr1_1_5147117 1.942835e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 3.885671e-07 6.955351e-05 . #> chr1_10294234_15441350 . . . . #> chr1_15441351_20588466 . 6.022790e-05 . 1.942836e-07 #> chr1_20588467_25735583 5.828506e-07 . 1.942835e-07 . #> chr1_25735584_30882699 . . . . #> #> chr1_1_5147117 . . . 3.419390e-05 #> chr1_5147118_10294233 1.942836e-07 . . . #> chr1_10294234_15441350 . 1.942835e-07 . 1.942835e-07 #> chr1_15441351_20588466 1.942836e-07 . . . #> chr1_20588467_25735583 . . . 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 . 2.059406e-05 1.942836e-07 1.942836e-07 #> #> chr1_1_5147117 . 3.88567e-07 . . . #> chr1_5147118_10294233 . . . . 2.078834e-05 #> chr1_10294234_15441350 5.653650e-05 3.88567e-07 . . . #> chr1_15441351_20588466 . . . . . #> chr1_20588467_25735583 . . . . . #> chr1_25735584_30882699 4.429665e-05 . . 5.828507e-07 . #> #> chr1_1_5147117 . #> chr1_5147118_10294233 3.885671e-07 #> chr1_10294234_15441350 . #> chr1_15441351_20588466 1.554268e-06 #> chr1_20588467_25735583 1.942835e-07 #> chr1_25735584_30882699 .